宏微特斯再度携手国家级科研团队，深度解析青藏高原布鲁氏菌跨物种传播特征
发布时间：
2026-06-26
继浙江省牛种布鲁氏菌全基因组溯源研究之后，宏微特斯生物信息团队再次参与合作的布鲁氏菌基因组研究《Identification and Genome Phylogenetic Analysis of Three Brucella abortus Strains From Sheep, Yak, and Cow in Qinghai, China》于2026年发表在Transboundary and Emerging Diseases（IF=3.4）。该研究由兰州兽医研究所、青海省地方病预防控制所、中国 CDC 传染病预防控制所等机构联合完成，北京宏微特斯生物信息部作为共同作者，负责全基因组比较分析、系统发育推断与可视化工作。
研究背景
青海是我国布鲁氏菌病高发区，人间发病率从2019年的2.45/10万升至2023年的 34.86/10 万。既往分子流行病学集中在 B. melitensis，而对同样在牛、牦牛、野生动物中循环的B. abortus缺乏系统性基因组研究。本研究从2015–2016年青海家畜流产胎儿脾脏中分离得到3株 B. abortus——分别源自绵羊（BA0611）、牦牛（BAHYS）、牛（BAQHM），辅以2株既往分离株（QH5、QH22）做谱系对照，填补了青藏高原牛种布鲁氏菌在多宿主间传播机制的数据空白。
1. 证实“跨物种”聚集性感染
研究从绵羊、牦牛、牛三个物种中分离到的菌株（BA0611, BAHYS, BAQHM），经MLST鉴定均为ST2型。这三种看似独立的动物感染病例实际上来自同一个传染源（Cluster感染）。这打破了以往认为不同宿主携带不同菌株的认知，提示在青海牧区，牛羊混养导致的交叉感染风险极高。
2. 发现独特的“毒力缺失”谱系
这三株菌虽然保留了大部分毒力基因（69个），但一致缺失了三个关键基因： bmaA、btpB、virB10。尽管缺失了这些基因，菌株依然能在青藏高原的动物群体中稳定流行。这暗示了该区域流行的菌株可能发生了代偿性进化，或者高原特殊的环境压力筛选出了这种特殊的弱毒/适应性谱系。这为理解布鲁氏菌的致病机制和宿主适应性提供了全新的视角。
3. 青藏高原内多谱系共存
cgSNP 树显示青海株分为两个亚支：
亚支I：青海动物株（BA0611/BAHYS/BAQHM）与西藏牦牛株（XZ19-1）、俄罗斯株聚为一支；
亚支II：青海人源/旱獭株则与中国北方（宁夏、黑龙江、河北）的菌株亲缘关系更近，这说明青藏高原并非只有一个单一的布鲁氏菌传播链，而是存在至少两条独立的进化路径。这可能与历史上的牲畜迁徙路线有关（如跨区牲畜流动、跨境贸易等）。
宏微特斯技术支撑
该研究首次提供了青海高原三种主要家畜宿主 B. abortus 的全基因组证据，拓展了区域内的宿主谱认知，并为 One Health 框架下的跨宿主监测、溯源与精准防控提供了遗传学基准。
宏微特斯在项目中输出的WGS 数据分析 + 高分辨率 cgSNP 系统发育 + 毒力/耐药功能注释能力，与此前浙江B. abortus 七株溯源研究形成互补——前者提示"北方种南下的输入事件"，后者揭示"高原多宿主本地谱系与跨区交流"。两套数据集共同印证：cgSNP 级别的分辨率对布鲁氏菌这类低多态性病原的溯源不可或缺，而跨区域、跨宿主的基因组监测网络是未来布病消除的关键基础设施。
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