Virome characterization of wild smallmammals provides new insight into zoonoticpathogens in West Africa
发布时间：
2026-03-30
研究团队采用病毒宏基因组学技术，对2018-2023年间在塞拉利昂采集的846只野生小哺乳动物（按物种和采样地点分为49个样本池）开展了系统的高通量测序分析。关键实验流程如下：
✅样本处理：采集动物心脏、肝脏、脾脏、肺和肾脏组织，混合匀浆后提取总RNA。
✅测序与组装：去除核糖体RNA后构建文库，使用Illumina NovaSeq 6000平台进行测序，通过de novo组装获得病毒重叠群。
✅病毒鉴定：基于RNA依赖的RNA聚合酶（RdRp）基因进行比对，筛选出脊椎动物相关病毒，并排除了细菌、真菌和植物病毒。
✅生物信息学分析：包括系统发育分析、重组事件检测、跨物种传播网络分析以及人畜共患潜力评估。
✅血清学回溯：针对预测具有高人畜共患潜能的蝙蝠莱丹病毒2型，构建VSV假病毒系统对当地居民血清进行中和抗体检测，发现2.8%的检测对象携带特异性中和抗体，为该病毒的潜在跨种传播提供了关键血清学证据。
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