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【产品名称】 人ROS1融合基因突变检测试剂盒(荧光PCR法)
【包装规格】 20人份/盒、50人份/盒
【预期用途】
本检测试剂盒用于体外定性检测人非小细胞肺癌患者样本中ROS1融合基因14种突变型别(表1)。其检测结果仅供临床参考,不应作为患者个体化治疗的唯一依据,临床医生应结合患者病情、药物适应症、治疗反应及其他实验室检测指标等因素对检测结果进行综合判断。
ROS1是胰岛素受体家族的一种跨膜酪氨酸激酶,ROS1融合基因被证实为又一重要的非小细胞肺癌驱动基因,作为新的独特分子亚型代表,ROS1融合基因在NSCLC中发生率约为1%~2%[1,2]。ROS1主要在其外显子32、34、35和36处发生基因重排,其与CD74、EZR、SLC34A2、SDC4等基因发生融合后,会持续激活ROS1酪氨酸激酶区域,异常活化的ROS1激酶可激活下游RAS/MAPK/ERK、PI3K/Akt/mTOR、JAK3/STAT3等信号通路,从而参与肿瘤细胞的增殖、分化与转移,引起癌症的发生[2]。ROS1融合突变中,CD74-ROS1约占42%,EZR约占15%,SLC34A2约占12%,SDC4约占7%[3]。研究表明,ROS1激酶催化区的ATP结合位点与ALK激酶催化区的ATP结合位点二者同源性高达77%[4],因此ALK酪氨酸激酶小分子抑制剂克唑替尼(crizotinib)等在治疗ROS1发生融合变异的NSCLC中具有明显疗效[5,6]。因此,检测ROS1融合突变情况是指导 Crizotinib 类药物用药的前提和基础。本检测试剂盒用于指导ROS1抑制剂类药物的用药,为非小细胞肺癌患者的个体化医疗提供依据。
表1 可检测的突变型
编号 |
拼接基因 |
拼接外显子 |
ROS1拼接外显子 |
Cosmic ID |
1 |
SLC34A2 |
Exon13 |
Exon32 |
COSF1260 |
2 |
SLC34A2 |
Exon4 |
COSF1197 |
|
3 |
SDC4 |
Exon4 |
COSF1279 |
|
4 |
SDC4 |
Exon2 |
COSF1266 |
|
5 |
CD74 |
Exon6 |
COSF1203 |
|
6 |
CD74 |
Exon6 |
Exon34 |
COSF1201 |
7 |
EZR |
Exon10 |
COSF1268 |
|
8 |
SDC4 |
Exon4 |
COSF1280 |
|
9 |
SLC34A2 |
Exon4 |
COSF1198 |
|
10 |
SLC34A2 |
Exon13 |
COSF1261 |
|
11 |
GOPC |
Exon8 |
Exon35 |
COSF1251 |
12 |
LRIG3 |
Exon16 |
COSF1270 |
|
13 |
TPM3 |
Exon8 |
COSF1274 |
|
14 |
GOPC |
Exon4 |
Exon36 |
COSF1295 |
【检验原理】
本试剂盒采用荧光探针实时PCR技术,针对ROS1融合基因14种融合突变及内参基因靶序列,设计荧光检测的特异性的引物探针,特异性探针5’标记为FAM荧光基团(14种融合突变)和HEX(VIC)荧光基团(内参),3’标记为BHQ1淬灭基团。提取的RNA经逆转录为cDNA,在PCR扩增过程中,特异性引物和探针分别与各自靶序列结合,当Taq酶遇到结合在靶序列上的探针时,发挥5’端外切酶功能,使报告荧光基团和淬灭基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步,通过四个反应液实现对样本中14种融合突变的定性检测及内参的检测。
同时引入内源内参质控,作为对试剂、RNA质量以及操作本身的质控,即便RNA有降解,通过内参能够真实地反应体系中有效的RNA量。
【储存条件及有效期】
- 未开封的试剂盒:应在避光、温度不高于30℃下储存,有效期12个月。
- 撕开密封袋后,管内的冻干试剂应立即使用。
- 冻干的核酸反应液复溶后立即进行RT-PCR检测,否则应避光储存于-15℃以下,有效期为1周,避免反复冻融(应限制在2次以内)。
- 冻干的阳性对照复溶后,应储存于-15℃以下,有效期为1周,避免反复冻融(应限制在2次以内)。
- 运输条件: 低于37℃可稳定运输1个月。
- 生产日期、生产批号及失效日期见包装标签。
【适用仪器】
ABI7500荧光定量PCR仪、ABI7500Fast实时荧光定量PCR系统、QuantStudio®5实时荧光定量PCR系统、宏石SLAN-96P全自动医用PCR分析系统、LightCycler® 480荧光定量PCR系统、杭州博日FQD-96A荧光定量PCR仪、雅睿MA-6000荧光定量PCR仪、伯乐BioRad CFX96实时荧光定量PCR仪和伯乐CFX Opus 96实时定量PCR仪。
【样本要求】
- 样本来源:石蜡包埋病理组织或切片样本。
石蜡包埋病理组织或切片样品应确定含有肿瘤病变细胞(建议含量在30%以上),所取部分尽量在蜡块中部,石蜡切片数应不少于3张,厚度在5-10 μm。且手术切除的组织应尽快在4-10%的福尔马林中固定,固定时间以8-24 小时为宜;包埋前应进行彻底脱水。建议选择未超过2年的NSCLC石蜡包埋组织样本。
- 样本采集注意事项:样本在采集、保存和转移时避免污染。
样本安全性:所有样本均视为有潜在的感染性,操作时按国家相关标准执行。
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