宏微特斯“新病原发现利器”助力刘玮教授团队再发NEJM——一种新的蜱传湿地病毒

分类：公司新闻
发布时间：2024-09-11 16:56

【概要描述】2024年9月4日，中国军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所刘玮研究员、黎浩研究员、李昌研究员在New England Journal of Medicine《新英格兰医学杂志》上发表了题为A New Orthonairovirus Associated with Human Febrile Illness的论文（IF=96.2）。该研究从内蒙古一湿地公园的蜱叮咬病人中分离鉴定出一种新的蜱虫病毒—湿地病毒（Wetland virus, WELV），并提示该病毒与我国东北地区的发热性疾病有关。

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宏微特斯“新病原发现利器”助力刘玮教授团队再发NEJM——一种新的蜱传湿地病毒

【概要描述】2024年9月4日，中国军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所刘玮研究员、黎浩研究员、李昌研究员在New England Journal of Medicine《新英格兰医学杂志》上发表了题为A New Orthonairovirus Associated with Human Febrile Illness的论文（IF=96.2）。该研究从内蒙古一湿地公园的蜱叮咬病人中分离鉴定出一种新的蜱虫病毒—湿地病毒（Wetland virus, WELV），并提示该病毒与我国东北地区的发热性疾病有关。

分类：公司新闻
发布时间：2024-09-11 16:56
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2024年9月4日，中国军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所刘玮研究员、黎浩研究员、李昌研究员在New England Journal of Medicine《新英格兰医学杂志》上发表了题为A New Orthonairovirus Associated with Human Febrile Illness的论文（IF=96.2）。该研究从内蒙古一湿地公园的蜱叮咬病人中分离鉴定出一种新的蜱虫病毒—湿地病毒（Wetland virus, WELV），并提示该病毒与我国东北地区的发热性疾病有关。

这是继2022年合作助力在NEJM发表琅琊病毒新病原后，采用宏微特斯的新发病原体发现系列工具包，再次助力疾病监测网络快速发现新病原。相同技术路线方法（潜在新病原发现分子方案）连续发现新发病原，凸显了反向病原学在识别潜在未知人类病原体方面的显著优势与能力，进一步通过后续传统的科赫法则验证，能够快速识别新病原。

在本次研究中，采用宏微特斯新一代高灵敏的宏基因组测序工具，通过对蜱虫/临床样本开展检测，利用宏微特斯配套开发的新发病毒预测工具发现了湿地病毒。

根据发现的湿地病毒序列，快速设计特异的荧光PCR检测产品，对媒介蜱虫、动物和发热人群样本进行荧光PCR检测，5249组蜱虫混合样本中309组病毒核酸检测阳性；682例发热患者中20份样本病毒核酸检测阳性；羊（16/700）、马（1/19）、猪（1/111）等多种动物体样本也均检出了湿地病毒RNA。

8个患者双份血清（急性期、恢复期）抗体检测结果显示所有患者存在血清抗体阳转或4倍以上抗体效价升高；对当地640份无症状人群血清样本抗体检测，12份样本抗体IgG阳性（1.2%）。

进一步对湿地病毒核酸检测阳性的样本开展分离培养并进行PCR病毒载量监测，核酸检测阳性的培养物进行病毒全基因组测序，采用宏微特斯自主建立的病毒全基因组及末端快速测序工具，完成了病毒perfect全基因组测序。

湿地病毒的基因组包括L、M、S三个片段，基于全基因组序列比对与系统发育分析，发现该病毒的基因组特征与已知的布尼亚病毒目正内罗病毒属成员相近，但在系统进化树上形成了一个单独的分支，与正内罗病毒属中Tofla virus核苷酸同源性最高，约为74%-81%，与Crimean–Congo hemorrhagic fever virus（CCHFV）核苷酸同源性约为66%-72%。

潜在新病原发现分子方案

科赫氏法则发展于十九世纪，是以当时技术水平能用来辨认病原体的技术通则，尤其对细菌类致病菌的确认具有很好的指导。但在日常实践中，科学家们发现该理论存在一些缺陷。今天，随着高通量测序技术在新发病原发现中越来越广泛应用，把科赫法则作为一种研究思路，学习科赫法则中有用的东西，梳理总结以下基于序列发现为基础的新型潜在新病原发现的分子方案。

1.通过宏基因组测序等技术获得的基于序列发现的新微生物，获得的新微生物序列在在同源物种基因组结构上分布均一；或者基于序列的新微生物的证据链可以被重复。

2.针对该新型微生物，首先开展系统进化分析，根据该微生物群体的已知种类，尤其是近源种类的生物学特征，推定潜在的致病性。

3.在推定潜在感染某种传染病的大多数病例中，应该存在该种新病原体的核酸序列，且在人体有病变的器官或组织中载量更高，随着疾病的消退，与病原体相关的核酸序列拷贝数应相应递减或检测不到，反之则反。

4.开展体外人源和哺乳动物敏感细胞实验和动物体内实验，初步评定致病性；或者基于已知序列和基因，研制抗体检测方法，基于人群血清流行病学可以检测到抗体/基于疑似病人样本抗体四倍升高或阳转；或者采用探针原位杂交的方式，在细胞水平证明推定的微生物和感染的组织部位有关。

宏微特斯反向病原学工具包产品信息

由宏微特斯再次助力刘玮团队在NEJM上首次报道并命名正内罗RNA病毒——湿地病毒，这一发现凸显了宏微特斯基于反向病原学技术路线的新发病原体发现工具包，在识别未知人类病原体方面的显著优势和潜力，能够作为广大未知、新发病原监测研究人员的有效工具，助力潜在新病原的快速发现。此外，WELV作为近期被识别的病原体，更深入的研究前景广阔，宏微特斯可提供湿地病毒系列检测产品，助力WELV在临床检测、致病性以及传播机制等研究领域的进一步探索。

01 宏微特斯新一代（三代）宏基因组测序与新发病毒预测发现工具介绍

宏微特斯PTNseq感染病原微生物纳米孔基因检测产品，采用多重 PCR 建库体系，应用nanopore三代测序技术，针对感染性疾病靶向病原体及耐药基因进行种特异检测，同时含种属特异宏病原覆盖，实现病原广谱精准检测的同时保持病原宏基因组测序发现新病原的能力。特征数据库配合实时分析的自动化分析一体机，实现真正的病原测序检测产品实时分析。

宏微特斯PTNseq靶向广谱宏基因组产品图

分析一体机及报告系统页面图

产品特点

快：最快周期可达6个小时，做到当天样本当天出结果；

高：灵敏度高，2轮PCR，病原富集效果好，可提升相应mNGS病原体10-100倍检出序列数。

好：样本及仪器兼容性好，起始量1ng即可以建库，适用于二代及三代测序设备；

省：病人花费省，自主配套nanopore研发的捕获、建库试剂，极大降低成本，更经济；

全：涵盖呼吸、中枢、血液等主要感染病原体355种，种属特异宏病原覆盖10376（亚）种；

简：可配备自动化建库，一站式分析，硬件+软件双重加速一键生成报告实时分析的自动化分析一体机，实现真正的病原测序检测产品实时分析。

02 宏微特斯全基因组测序工具（多重扩增全基因组富集工具）介绍

病毒全基因组富集工具（多重扩增法），可快速设计目标病毒全基因组多重扩增试剂并进行高效富集扩增，适配二/三代平台进行建库测序，获取病原体全基因组序列，对于了解病毒的流行病学特征、追踪病毒传播链以及制定针对性的防控措施具有重要意义。

产品特点

操作简便：叠瓦式引物设计，一次扩增，即可获得目标病毒全基因组序列

灵敏准确：可检测低至32CT样本，满足更高质量基因组组装

超快检测：通过自动化设备进行病原富集建库，联合ONT平台可实现6-8小时内完成基因组组装

平台兼容：适配ONT、齐碳、SALUS Pro、lllumina、MGI等二、三代主流测序平台

湿地病毒全基因组富集试剂盒（多重扩增法）产品图

湿地病毒全基因组富集二代测序S/M/L片段覆盖度

全自动一体化卡盒式建库系统(AIOS)是由应用于目标区域捕获及高通量测序(NGS)文库制备的全自动化封闭式反应系统。系统由一体化建库卡盒，以及内置升降温模块的建库单主机AIOS-100或多联机AIOS-800，以及配套的软件组成。制备程序按照标准化生产模式开发设计,满足用户对个性化实验需求的编辑与自由组合，搭配封闭式预装试剂盒，为二/三代基因测序实现一体自动化捕获、纯化与文库制备赋能。