人腺病毒全基因组检测通用试剂盒 (多重扩增法)
- 分类:公司新闻
- 发布时间:2024-07-25 15:07
【概要描述】近期,多省腺病毒感染病例增加,浙江某医院一个月确诊超700例,引起广泛关注。儿童感染该病毒后多因反复或持续的高热就诊,而退热药退热效果不佳,抗生素治疗也无效,目前尚无特效药,因此,腺病毒被儿科界誉为“新一代毒王”。
人腺病毒全基因组检测通用试剂盒 (多重扩增法)
【概要描述】近期,多省腺病毒感染病例增加,浙江某医院一个月确诊超700例,引起广泛关注。儿童感染该病毒后多因反复或持续的高热就诊,而退热药退热效果不佳,抗生素治疗也无效,目前尚无特效药,因此,腺病毒被儿科界誉为“新一代毒王”。
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近期,多省腺病毒感染病例增加,浙江某医院一个月确诊超700例,引起广泛关注。儿童感染该病毒后多因反复或持续的高热就诊,而退热药退热效果不佳,抗生素治疗也无效,目前尚无特效药,因此,腺病毒被儿科界誉为“新一代毒王”。
7月15日初伏,正式进入三伏天,迎来一年中最闷热、潮湿的时段。尤其是在我国南方,气候和环境适合病毒细菌等微生物的繁殖,包括腺病毒。
腺病毒是引起急性呼吸道感染(ARTI)的重要病原体之一,经常引起爆发性流行。据文献报道,在2009-2020年期间,共报道了97起腺病毒感染的爆发性流行,总的发生率约为15.91%;其中南北方的发生率(19.01%)高于南方(13.53%)。
在腺病毒感染的爆发性流行事件中,总体来说在夏季(16.76%)和冬季(22.65%)发生率较高。北方的腺病毒感染爆发性流行常发生在冬季,南方则在春夏季和冬季。
什么是腺病毒?
人腺病毒(Human adenovirus, HAdV)属于哺乳动物腺病毒属,为无包膜的双链DNA病毒,病毒颗粒呈二十面体对称结构,直径 90~100nm,可划分为A-G共7个亚属,目前已发现至少114个基因型别。与呼吸道疾病相关的腺病毒主要有B亚属(3、7、11、14、21、34、35型)、C亚属(1、2、5型)和E亚属(4型);与胃肠道感染相关的主要为F亚属(40、41型)和G亚属(52型)。此外,19型和37型可引起眼部疾病,12型和31型可引起泌尿系统疾病。
HAdV-3 和 HAdV-7 型是儿童下呼吸道感染最重要的人腺病毒型别;HAdV-55 型自首次在我国发现以来,已在全国形成广泛流行,成为我国成人社区获得性肺炎的重要病原体之一。 各型腺病毒之间也可因基因重组而产生新型腺病毒,从而造成新发感染。
HAdVs是呼吸道感染的重要病原体之一,腺病毒肺炎约占社区获得性肺炎的4%~10%。呼吸道感染人腺病毒后主要表现为隐性感染、急性上呼吸道、下呼吸道感染,少数可发展为重症肺炎。多数患者以急性上呼吸道感染为主,但部分患者还可出现下呼吸道感染,还有少数患者发展为重症,甚至出现死亡。腺病毒的血清型跟临床表现密切相关。因此,腺病毒的分型检测对于临床的诊疗具有重要的指导意义。
中国疾病预防控制中心于2019年发布的《人腺病毒呼吸道感染预防控制技术指南》中提出需要对腺病毒感染样本进行分型靶基因序列测定及上报。
宏微腺病毒全基因组检测产品
人腺病毒全基因组检测通用试剂盒(多重扩增法)(HWKF-TW0201)采用多重PCR扩增技术构建高通量测序文库。使用一套腺病毒全基因组扩增引物,将腺病毒基因组扩增为34个重叠片段,结合高通量测序技术及生物信息技术,获得腺病毒的全基因组序列。
产品特点
1、高效:操作简单且检测效率高,一次PCR反应同时扩增人腺病毒B3、B7、B11、B14、B21、B55型全长序列;
2、均一:基因组覆盖均匀,各型别覆盖度均能达到99.8%以上;
3、兼容:测序经济、所需数据量少,适用于所有illumina、MGI、Nanopore等测序平台。
4、自动化分析:可精准分型,适配自动化分析系统,缩短报告时间。
分析示例
1、不同亚型样本覆盖度情况:基因组覆盖均匀,各型别覆盖度>99.8%。
样本覆盖度图示意
2、与疾控单位合作测试样本情况:
近期我司与多家疾控单位合作,开展腺病毒样本的全基因测序分型溯源工作。共测试40例以上腺病毒感染呼吸道样本,均取得完整基因组序列,覆盖度达99%以上。下载感染人类腺病毒主要流行型别参考序列,使用Mega 11软件构建全基因组序列N-J法进化树。经进化树溯源鉴定,南方地区某疾控单位收集到的腺病毒样本感染类型主要为HAdV B21型和B3型;北方地区某疾控单位收集到的腺病毒样本感染类型主要为B3型。
为验证某地区腺病毒样本中是否存在重组情况,我们使用 RDP 5.57软件和 SimPlot 3.5.1软件进一步分析了腺病毒全基因组序列,鉴定样本的重组模式。在部分样本中发现重组事件发生,其中某分型为HAdV-B21型的样本,其衣壳蛋白五邻体(Penton)基因区段,存在HAdV-B3亚型相似度更高的片段,两个重组分析软件共同鉴定出一致的重组事件。病毒衣壳蛋白基因存在高核苷酸多样性和高频的重组事件,提示在中国进行人腺病毒流行病学监测的必要性。
试剂盒采购信息
货号 |
产品名称 |
规格 |
备注 |
HWKF-TW0201/ HWKF-TW0201A |
人腺病毒全基因组检测通用试剂盒(多重扩增法) |
24人份/盒 |
自动/手动版 |
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